小智乘骑着喷火龙前往那个混乱核心的路途的时候已到中午，小智打给了大木博士“大木博士我这里出了一点状况，可能还需要一两天的时间才能回去，还有麻烦您帮我联系一下布拉塔诺博士，让他联系一下瑟蕾娜，让她前往密阿雷市。并希望让布拉塔诺博士帮我照看一下她，我大概过一两天便会回去接她。”
而大木博士则是听着小智那喋喋的嘱咐中不由开始胡思乱想了起来........“小智难不成你和瑟蕾娜吵架了？小智你是个男生所以你应该多让着点瑟蕾娜你知道不！”大木博士一阵过来人般的说道。
小智则是无奈的说道“你误会了，我这边遇到了一点事情，没办法顾及到瑟蕾娜就只好暂时先分离了。而且大木博士我记得菊子婆婆到现在还打着想撂倒你得注意呢啊。”小智表示叫你老不修，看我不把你老底揭开喽！
大木博士则是略显尴尬说道“好好好，我知道了，我会通知布拉塔诺的。还有你小心一点！要知道进退！”大木博士说完不忘嘱咐一下，毕竟他是知道的需要小智现在注意的事件一定不简单，便不由得也是有些担心。
小智则是挂断大木博士的电话后，闭目养伤开始调整自己的身体状态，毕竟一会说不定是场苦战呢！
而另一边的瑟蕾娜则是调整好情绪，收拾起了所有行囊和宝可梦（小智将精灵球留下了），十分坚毅的带着小软乘上了比雕前往了密阿雷市，心中也在不断的为小智祈祷，更是有些许埋怨自己的实力低微，并且下定决心自己也要提升实力以后可以帮助小智而不再是小智的累赘！中途瑟蕾娜接到了布拉塔诺博士的电话，说道小智让她在密阿雷市等着自己，并叫了柚莉嘉来陪自己（布拉塔诺博士帮忙叫的，毕竟答应大木博士和小智帮忙照看瑟蕾娜）。听完的瑟蕾娜不由的心中一暖，有时有些担忧的想到：小智你一定要平安无事的回来啊！
另一边混乱的核心地域里几十只暗黑宝可梦正在里面巡逻着，而他们保卫的跟原则是，一团幽绿色自然能量，便是这股能量的缺失导致的卡洛斯地区生态的不平衡！也是暗黑宝可梦的创始世者阿尔基斯留下的后手！因为当时产生暴虐情绪的阿尔宙斯并无生命宝玉的几块石板的力量，所以导致由阿尔宙斯负能量诞生的阿尔基斯也没有这几块石板的力量！所以阿尔基斯便是再与阿尔宙斯的决战之前留下了这个后手，他使用超强的神通力汇聚着卡洛斯地区的自然能量！为其破关后可为他使用凝聚出新的草系石板！但可惜的是残留在卡洛斯地方的暗黑宝可梦实力并不强悍（阿尔基斯认为的），总共26只的宝可梦里有三只冠军级的宝可梦和七只准冠军级的宝可梦和剩下的十六只天王级的宝可梦，如果将这支宝可梦小队放出去的话，不管在哪个地区的城市都可以将其遗平！（除地区联盟驻扎城市）而此时所收集的能量想凝聚草系石板连三分之一都不够！但这固力量已经可以匹敌一只二级神了！
时至落日小智也快到了混乱核心的所在地区！但是小智却总感到有些许的不安心，这时小智的图鉴响起，小智一看是一个陌生陌生的联系人（你真的很可以，不存自己女朋友的联系方式！），便是有些犹豫的的接起。
“小智你个混蛋！你长本事了啊，居然敢骗我！我告诉你如果你不能平安无事的回来，我这辈子都不会原谅你的！”听着瑟蕾娜略带哭声的咆哮，小智起初有些发愣他好像看到了重生前已经成年的瑟蕾娜！在意错愕中听到了那带着关心的话，小智不由得心中一软。
“放心吧，瑟蕾娜我一定会平安无事的回去的！”
听着小智那坚定的语气，瑟蕾娜也是强忍着心中的悲伤强做笑容道“我相信你，小智！你一定会平安无事的回来的！”
就在两人沉默不语沉默中，一旁的布拉塔诺博士上前说道“小智你的图鉴现在电量如何？”
“布拉塔诺博士我的图鉴现在处于接近满格的能量。”小智若有所思的说到。
“那太好了，小智你只带走了三只宝可梦我们都不是很放心所以向你可以在传送两只宝可梦过去可以援助你，你觉得如何？”说完布拉塔诺博士和瑟蕾娜还有一旁为上境的柚莉嘉和希特龙都是担忧的看着图鉴里的小智。
小智则是沉思了片刻说道“那就麻烦博士将蜥蜴王与火爆猴传送给我吧！”再小智心里蜥蜴王是仅次于喷火火龙他们之下的准冠军级，也是可以作为大范围战力一大好伙伴，可以很好的完善在混乱核心地区的应对；火爆猴也是同理，火爆猴是一只肉体强悍又有着丰富战斗经验的宝可梦，如不是受到天赋的限制，他将不止于天王的境界！这一帮他弥补了遇近身守护与范围性攻击的短板！
“好的我现在就为你传输！”说完布拉塔诺博士便是将两只宝可梦传送了过去.......
月亮升起，大概晚上八点小智抵达了基格尔德所提供的混乱核心地区的位置！此处就在白檀森林的核心区域的一个洞窟里！小智躲在远处使用波导感知着这个漆黑的洞窟，便发现洞窟门口正有两只准冠军级和四只天王级宝可梦守着，而在波导的感知里守卫着这个洞窟的宝可梦均为暗黑宝可梦！小智虽是有些许震惊但是会想起时空宝树给予的上古秘闻便是心中了然，看来这自然的失衡便是那阿尔基斯造成的，估计这里是他留下的一个后手！
想及小智便是开始思考该如何攻入迷宫，就在这一刻一道破坏死光射来！小智的波导急忙预警，才幸免于难！小智这才看到了攻击自己的宝可梦原来是一只冠军级的暗黑黑鲁加！而且可以发现的是这只黑鲁加居然是出于Mag进化状态！小智没时间在思考迅速放出其余宝可梦，“喷火龙龙之舞，火爆猴集气，皮卡丘使用电网，蜥蜴王使用疯狂机器！甲贺忍蛙使用求雨！”
说完小智的宝可梦们纷纷使用绝招！而那只冠军级的暗黑黑鲁加则是带着门口的六只宝可梦冲了过来，可以发现的是这六只宝可梦也都是黑鲁加只不过是普通形态的。而小智的宝可梦们释放的技能也是起到了效果一只天王级的黑鲁加很倒霉的被皮神的击中了电网击中！后被掩埋在了疯狂机器的巨型藤蔓植物之下。冠军级暗黑黑鲁加带领着其他黑鲁加使用了蓄能焰袭冲击了过来，如果被这群暗黑黑鲁加的蓄能焰袭集中的话小智不敢想象，旋即便是立刻下达命令说道“甲贺忍蛙水流喷射攻击这群黑鲁加的侧翼！火爆猴和我乘上喷火龙升空！然后蜥蜴王和皮卡丘使用电光一闪加上影子分身，配合叶刃与铁尾配合甲贺忍蛙袭扰黑鲁加们！”
小智心想就等这计蓄能焰袭后继无力便是之地最佳时机！可就在小智想好计划的时刻！一群乌贼王出现在视野里！而这出现的就有整整十只其中更是有着一个冠军和三个准冠军，小智开始头皮发麻这样办的困境简直就是死局！
就在小智绞尽脑汁的时候，这群以阴险狡猾之称的乌贼王们射出了精神强念，而喷火龙则是一个不慎没躲开精神强念被集中陷入了混乱，而小智与火爆猴也被甩飞了出去，小智借助波导之力送空中稳定了身行落在了地面。火爆猴也是落地滚了一圈稳住了身形，而喷火龙则是有些狼狈的落了地！
小智心里一片阴郁，心中有些许后悔，早知道应该将所有宝可梦都带来的！