法国有4艘帆船和13只海船，其中包括一艘拿破仑私人的拥有120门重炮的战舰，叫做东方号。在布鲁依斯的带领下，法国人为了能有一个稳定的开火平台而在海岸附近停靠。他们甚至从犁侧板卸下加农炮，为的是更好地向海面上的敌舰射击。
相比之下，纳尔逊却只有13艘海船。他在夜幕降临时大举进攻，率领他的舰队将法国舰队逼到了离海岸稍远的地方，法国舰队的整体战线被纳尔逊舰队搅得混乱不堪，他们的大炮与船员全部错位。纳尔逊的军队给敌人以致命一击。不到20分钟，法国的头3艘船就静了下来，没有任何反应了。8点左右，法国5艘打头阵的船全部投降。
在作战时，纳尔逊不幸被一块铁片残体击中了一只眼睛。他失血过多，已经神志不清。其他同僚都以为他马上要死了，让人把他抬了下去。纳尔逊早已料到这种局面，并且已经准备好了给他妻子的最后一封信。他拒绝在其手下面前接受治疗。等他的伤口都缝合后就有消息传来东方号起火了。纳尔逊坚持让别人扶着他再次回到甲板上去察看情况。
事情是这样的：在当晚10点左右，东方号的火药库爆炸了，轰隆声震耳欲聋，甚至距离爆炸点20千米远的亚历山大港的人都听得非常清楚。法国舰队总司令布鲁依斯也死于爆炸。纳尔逊派出了唯一完好的船去营救幸存者，直到第二天下午战役才告结束。
在这次战役中，英国舰队的船只没有一只失散，死亡人数仅为218人。法国则有1700人失踪，还有3000多人成了俘虏。纳尔逊被封为男爵，成了英国人民的英雄。法国人也没有做逃兵，他们奋战到底。不过法国与英国作战的17艘战舰只有4艘幸存，是法国舰队总司令维纶纽瑞下令让这4艘船撤回的。这个人在纳尔逊的生命中也有着重要的影响。
1801年，纳尔逊作为海德·帕克总司令的第二指挥官，随舰队前往哥本哈根。这支舰队被派去打破波罗的海各国间的军事平衡。纳尔逊参与了由托马斯·福勒志愿带头的登上皇家战舰野象号的行动。英国舰队与丹麦舰队交战，双方均损失惨重。帕克发出信号让纳尔逊脱离战斗。当纳尔逊注意到信号的时候，便举起望远镜，放在那只已经失明的眼前，告诉人们他没有看到任何指示。从这里还引出了一个词组”turningablindeye”，意思是假装没看见。
另一个”登场”的有趣的人物是威廉姆·布莱舰长，他在战役中指挥一艘有50门重炮的舰艇。在军事法庭宣告他对于那次由于战利品而引发的士兵骚乱不负有任何责任之后，布莱又恢复到了积极的工作中。
丹麦人使出了全力与身经百战的英国舰队交锋，但最后为了减少损失，还是同意了纳尔逊的停战提议并向其屈服。很快他们签订了停战协议，纳尔逊成为了当地的行政长官。他过去的指挥官约翰·杰维斯（现在叫厄尔·圣·文森特）与其他很多人一起向帕克和纳尔逊进入议会表示了祝贺。杰维斯谈到了法国入侵的可能：”我不能说这一天一定不会到来，但我可以预测他们不会从海上袭来。”
纳尔逊也许是英格兰在这方面最出名的人了。在走向泊在特拉法加的战船途中，人们都在街上为他下跪，表示尊敬。还有一些人把孩子举起来，为的就是让孩子们看一眼纳尔逊本人。法国舰队的主力在法国最西处——西班牙和布雷斯特（法国的一个港口城市）西南的加地斯被阻塞了，同时有大量的英国船只在大西洋海岸来回航行监视等着他们。这是1805年英国舰队在西班牙海岸附近一个消除法国的海上威胁的好机会。
特拉法加海战
在特拉法加，纳尔逊负责指挥舰队，科林伍德是第二指挥，诺塞斯克的厄尔为第三指挥。1805年10月21日战役打响，这一天也被定为特拉法加日。纳尔逊带领了27艘战舰与法国的33艘同等战斗力的战舰交战。纳尔逊的炮手们比法国人多发射了一倍的炮弹，准确率还远远高于法国人。英国水手们在战争中始终有勇有谋、团结一致，这成为他们的优势之一。